CRISPR służy do diagnozy

CRISPR służy do diagnozy

Technika CRISPR pozwala na edycję genomu z wysoką dokładnością, ale jego możliwości nie są ograniczone do tej aplikacji. Nowe odkrycia, które Engadget i The Verge mówią nam, otwierają drogę do wykorzystania CRISPR jako narzędzia diagnostycznego.

Jeden z systemów diagnostycznych opartych na CRISPR został opracowany w laboratorium przez Jennifer Dudne, jednego z pionierów technologii. Jej zespół eksperymentował nie ze zwykłą strukturą CRISPR-Cas9, ale z CRISPR-Cas12a, który w pracy dodatkowo tnie jednoniciowy DNA obok niego. Ta umiejętność została wykorzystana do wykrycia dwóch powszechnych typów wirusa brodawczaka ludzkiego, odpowiedzialnych za rozwój niektórych nowotworów.

Gdy CRISPR-Cas12a znalazł wirusowe miejsce DNA w zainfekowanej komórce, pociął specjalny fragment kwasu nukleinowego etykietą fluorescencyjną. W rezultacie sygnał został zwolniony, umożliwiając wizualne wykrycie obecności wirusa. System o nazwie DETECTR radzi sobie z jego pracą za około godzinę i kosztuje mniej niż dolara. Dokładność tej technologii wynosi od 92 do 100%.

Feng Zhang, kolejny weteran CRISPR, zastosował technologię do identyfikacji wirusów i bakterii, a także poszukiwania mutacji onkogennych na podstawie próbek krwi. System otrzymał nazwę SHERLOCK. W nowym badaniu jego zespół wprowadził zaktualizowaną wersję tej technologii. który jest trzykrotnie bardziej czuły niż poprzedni i jest w stanie jednocześnie identyfikować wirusy Zik i Dengue. System wykorzystuje kilka wersji CRISPR, w tym Cas13 i Csm6.

Wreszcie, zespół Davida Liu z Harvardu udowodnił, że CRISPR może być używany do monitorowania zdarzeń w komórce w czasie rzeczywistym. Studiując stosunek wyciętych fragmentów DNA w komórkach w normalnych warunkach i pod wpływem antybiotyków i chemikaliów, nauczyli się określać stan pojedynczej komórki.

Wszystkie trzy systemy wymagają dodatkowego rozwoju, aby wyjść poza laboratorium i stać się częścią medycyny klinicznej. Twierdzą jednak, że możliwości CRISPR nie są ograniczone do edycji genów. Technologia okazuje się uniwersalna i prawdopodobnie w przyszłości będzie jej jeszcze więcej.

Lista chorób, które można pokonać za pomocą CRISPR, jest stale uzupełniana. Niedawno dołączyli do nich zespół Martina-Bella, główny czynnik demencji u mężczyzn. Naukowcy otrzymali bezpośredni dowód, że usunięcie konkretnej mutacji może wyleczyć neurony uszkodzone przez tę chorobę.

Powiązane wiadomości